Juan Carlos Pírez, le comunicó al zaguero Facundo Vega que no será tenido en cuenta para la próxima campaña. Ante esto, la dirigencia le otorgará el pase libre para que pueda seguir vinculado a la actividad.
Vega llegó a Unión para disputar el Torneo del Interior 2007, en el que Unión cayó en la final ante Liniers de Bahía Blanca. Desde ese momento el «Colo» disputó todos los Torneos que jugó el «Celeste». (solo él y Jesús Collantes lo han hecho)
En 2008 logró el ascenso al Argentino «B» en Santa Fé bajo la conducciíon técnica de José Pintado. Un año más tarde se consagró Campeón, con Marcelo Zwicker como DT.
En el Argentino «A» en 4 temporadas, alternando como titular, Vega demostró estar a la altura de la categoría, dejando la vida en cada jugada defiendo la camiseta de Unión.